Ciao Andrea,
innanzitutto Auguri di Buon Natale a te e a tutti gli altri.
Sicuramente il problema è nelle impostazioni AUDIO di mixvibes.
Li puoi configurare le uscite e gli ingressi del software verso la scheda audio. Li dorai impostare che il deck 1 esca dal canale 1/2 della tua scheda e il deck 2 esca dal canale 3/4.
Ti consiglio comunque di fare anche l'update presente su questo forum.
Facci sapere

e se il problema c'è ancora, come dice Luxory posta un config report.